Afin d'améliorer le niveau d'intégration de l'organisation, le contrôle de gestion est parfois aidé d'un ERP (Enterprise Resources Planning) ou en français, progiciel de gestion intégré.

Sur ce système d'information de gestion le contrôleur de gestion puise selon ses besoins dans la comptabilité analytique, la comptabilité générale, la GPAO (Gestion de Production Assistée par Ordinateur), l'administration des ventes.

Les ERP représentent cependant des solutions lourdes et souvent difficilement maniables de telle sorte que des outils périphériques s'avèrent nécessaires (outils de business intelligence, de calcul de coûts, de tableaux de bord, web applications).